停工损失应当计入成本费用或损失费用的科目中。停工损失是因为生产线或设备故障、自然灾害、供应链中断等原因导致生产无法正常进行而产生的损失,应当在损失发生时及时计入相关的费用科目中,以反映公司的经营损失情况。这些损失费用应当在财务报表中进行充分披露,并及时进行成本控制和损失降低措施的制定,以减少对公司经营业绩的不利影响。